• Job Description

  Req#: 44706

  Acteur mondial dans le domaine du diagnostic in vitro depuis 60 ans, bioMérieux offre des solutions de diagnostic qui déterminent l’origine d’une maladie ou d’une contamination pour améliorer la santé des patients et assurer la sécurité des consommateurs.
  
  Rejoindre bioMérieux, c’est choisir une société familiale et humaniste, portée par une vision long terme, au service de la santé publique dans le monde.
  
  Chaque stagiaire ou alternant est accompagné par un tuteur expérimenté et formé. Il ou elle bénéficie d’un suivi et d’une évaluation l’aidant à progresser et à se préparer à la vie professionnelle.

  Sujet : Séries temporelles d’images pour le test rapide de susceptibilité des bactéries aux antibiotiques

  Résumé: Ce stage se situe dans le domaine des méthodes pour la détermination rapide de la susceptibilité des microorganismes aux antibiotiques. Ces méthodes sont généralement fondées sur l’observation de la croissance – ou non – d’une population homogène de microorganismes en présence de plusieurs concentrations d’un antibiotique donné.

  Certaines de ces méthodes utilisent la vision et l’imagerie comme outil de mesure. En particulier, les tests de diffusion d’antibiotiques reposent sur le dépôt local d’un antibiotique à la surface d’un milieu de culture préalablement ensemencé de façon homogène avec une suspension de microorganismes (gamme ETEST de bioMérieux). La façon dont le tapis bactérien se développe dans le gradient de concentration d‘antibiotique qui se forme sur la surface du milieu de culture renseigne sur le phénotype de résistance ou sensibilité du microorganisme à cet antibiotique.

  Quelle est votre mission chez bioMérieux ?

  L'objectif de ce stage sera la mise au point d'une nouvelle méthode optique et de traitement d'image, pour l'évaluation des performances de cette méthode pour la lecture de tests de susceptibilité aux antibiotiques par croissance microbienne sur milieu solide.

  Vous participerez à la mise en place d’un banc d’imagerie des boites de culture, en caractérisera les performances optiques, l’utilisera pour l’acquisition de séries temporelles d’images du pattern de croissance sur les boites et concevra les méthodes et outils d’analyse (Python, Matlab, R) permettant de prédire le phénotype bactérien.

  Qui êtes-vous ?

  • Vous préparez une formation niveau BAC+5, type Master ou école d'Ingénieur,

  • Vous avez des compétences en méthodes d’analyse en interprétation de données images, programmation en python et en vision par ordinateur (computer vision),

  • Vous avez la capacité de travailler en équipe dans un environnement pluridisciplinaire (sciences de la donnée, optique et instrumentation, microbiologie),

  • Des compétences en instrumentation optique sont un plus.

  Durée stage : 6 mois

  Contacts tuteurs: Emilie BISCEGLIA, emilie.bisceglia@biomerieux.com et Dominique DECAUX, dominique.decaux@biomerieux.com

  La gratification mensuelle pour un stagiaire est attribuée dès un mois de présence.
  
  Le montant de la gratification dépend du niveau de formation de l’étudiant et est supérieure au minimum légal.
  
  Les + :
  • Restaurant d’entreprise avec participation de l’employeur.
  • Remboursement de 100 % de l’abonnement de transports en commun ou indemnité de transport.
  • Conciergerie sur les sites de Craponne, Marcy et La Balme.

• About the company

  bioMérieux SA is a French multinational biotechnology company founded and headquartered in Marcy-l'Étoile, France, close to Lyon.

Notice